Luego, las vainas se colocan en grandes cajas de madera acolchadas con mantas de lana para evitar cualquier pérdida de calor durante 12 horas: vapor o sudoración.
Es en esta etapa que la vainilla toma su color chocolate, la catálisis de la fermentación permite el posterior desarrollo del sabor característico de la vainilla.
Las vainas se miden y clasifican una por una en «divididas», «sin dividir» y «negras y rojas».
La longitud y el color determinan el valor de la vainilla. Las vainas de la misma longitud y clasificación generalmente se atan juntas y se agrupan en paquetes.
Cada botín pesa aproximadamente 250 gramos (70 a 100 vainas), y el peso y la cantidad de vainas varían según el grado.
Las vainas se envasan en cajas de hojalata o cartón reforzado forradas con papel pergamino.
El envasado al vacío de vainilla sin atar pero clasificada en lotes de 1,5 o 10 kg y que permite una mejor conservación, ahora es de uso común, aunque esta medida se suspendió temporalmente en 2017 a pedido del gobierno malgache.
Todas estas operaciones conducen a una pérdida de peso del 40 al 50% con respecto al peso inicial.